Rienk Jiskoot studeerde aan het Koninklijk Conservatorium in Den Haag en behaalde er het solo-diploma voor orgel, piano en clavecimbel. Voor de studie van oud-Italiaanse orgelmuziek verbleef hij een jaar in Rome (1962/1963). Jarenlang was hij als hoofdvakdocent orgel verbonden aan het Koninklijk Conservatorium te Den Haag.